בטבע, שינוי צבע ביהלומים יכול להתרחש לאורך מיליוני שנים כתוצאה מחשיפה לקרינה רדיואקטיבית טבעית (לרוב מאורניום הנמצא בסלעים הסובבים) או כתוצאה מפגמים במבנה הסריג האטומי במהלך היווצרותם.
-
יהלומים ירוקים טבעיים
-
: יהלומים ירוקים טבעיים נדירים מאוד. הצבע הירוק נובע מחשיפה ממושכת לקרינה רדיואקטיבית טבעית. הצבע לרוב אינו אחיד ונוטה להיות מרוכז יותר בשכבה החיצונית ("עור") של הקריסטל. לעיתים קרובות, יהלומים ירוקים טבעיים מראים סימנים של "כתמים" או "חגורה" ירוקה. הגוון יכול לנוע מירוק בהיר מאוד ועד ירוק עמוק.
-
יהלומים כחולים טבעיים
-
: יהלומים כחולים טבעיים גם הם נדירים ביותר. צבעם הכחול נובע בדרך כלל מנוכחות של אטומי בורון בתוך סריג היהלום. גוון הכחול יכול לנוע מכחול בהיר מאוד ועד כחול עמוק ועשיר.
-
יהלומים ורודים טבעיים
: יהלומים ורודים טבעיים הם מהנדירים והיקרים ביותר. מקור הצבע הוורוד עדיין אינו מובן במלואו, אך ההשערה הרווחת היא שהוא נובע מעיוותים מבניים בסריג היהלום כתוצאה מלחץ עצום במהלך היווצרותו. הגוון יכול לנוע מורוד חלש מאוד ועד ורוד "פנסי" עז.
-
יהלומים חומים טבעיים
-
: יהלומים חומים הם הנפוצים ביותר מבין היהלומים הצבעוניים הטבעיים. צבעם החום נובע בדרך כלל מפגמים במבנה הסריג האטומי. הגוון יכול לנוע מחום בהיר מאוד (כמעט צהבהב) ועד חום כהה.
-
יהלומים צהובים טבעיים
: הצבע הצהוב ביהלומים טבעיים נובע בדרך כלל מנוכחות של אטומי חנקן בתוך סריג היהלום. גוון הצהוב יכול לנוע מצהוב חלש מאוד ועד צהוב "פנסי" עז.
זכור כי יהלומים צבעוניים טבעיים הם נדירים ויקרים ערך בהרבה מיהלומים חסרי צבע או יהלומים שצבעם שונה באופן מלאכותי.